Бизнес-процесс получения и учета торговым предприятием продукции, требующей сертификации в системе «Меркурий», выглядит следующим образом:

• организация-производитель, импортер или оптовый поставщик подконтрольной продукции (далее — Поставщик), формирует транспортную партию с указанием отправляемой продукции и дополнительными свойствами. Эта информация отправляется в ВетИС.API. Система «Меркурий» подтверждает возможность осуществить отправку продукции и на основании этих данных формирует ЭВСД. ЭВСД посылается и отправителю, и получателю.
  Отправителю для возможности напечатать документы для водителя.
  Получателю – чтобы принять и проверить правильность груза.
  На каждую позицию ТТН создается минимум один ЭВСД. Количество ЭВСД на строку ТТН зависит от того, сколько партий продукции (строк журнала регистрации в системе ВетИС) участвует в процессе для отправки одной строки ТТН. В эВСД указываются поставщик, получатель товара и реквизиты товара (см. справочник «Справочник «ВетИС: Ветеринарно-сопроводительные документы (ВСД)»»). В конфигурации торговое тпредприятие для формирования транспортного ВСД используется документ «ВетИС: Оформление транспортных партий»;
• до момента получения и подтверждения продукции остатки числятся за отправителем. Все субъекты, участвующие в хоздеятельности и способные повлиять на качество продукции должны быть зарегистрированы в системе «Меркурий»;
• эВСД автоматически загружаются в базу конфигурации посредством регламентного задания «ВетИС: Обработка запросов». Загруженные ЭВСД становятся доступны для просмотра в справочнике «ВетИС: Ветеринарно-сопроводительные документы (ВСД)»;
• после получения товара, в конфигурации оформляется поступление товара в товароучетной части конфигурации. Создаётся приходная накладная, в которой указывается либо реальное количество поступившего товара, либо количество товара по сопроводительным документам поставщика. При выявлении расхождения количества фактически поступившего товара с данными указанными в сопроводительных документах, на основании приходной накладной создается документ Акт разногласия» для выравнивания остатков по товарам. При выявлении расхождения количества фактически поступившего товара с данными указанными в сопроводительных документах, пользователь сам выбирает способ отражения расхождений: указывать в приходной накладной количество по документам и делать акт разногласия или сразу указывать реальное количество товара в приходной накладной;
• при оформлении приходной накладной рекомендуется заполнить поля «Входящий номер» и «Дата входящего документа» (реквизит «от»). Эти данные используются для автоматического поиска загруженных в систему эВСД и подстановки их в документ «Оформление входящих партий»;
• на основании проведённой приходной накладной создается документ «ВетИС: Оформление входящих партий». В него переносятся все строки ТТН, которые требуют подтверждения получения в ВетИС (продукция подконтрольная). Система указывает итоговое количество товара с учетом всех введенных на основании приходной накладной актов разногласия. Если документ «Акт разногласия» не формировался — количество товара берется из приходной накладной. При этом, если количество товара не равно количеству отправленного товара – осуществляется гашение ВСД с указанием номера документа разногласия –либо акт разногласия, либо приходная накладная (смотря где количество не сходится);
• в документ «Оформление входящих партий» автоматически подбирается эВСД для каждой товарной позиции. При этом, на каждую позицию приходной накладной с товаром, подконтрольным Россельхознадзору, указывается свой эВСД. В настоящее время имеется возможность указать 1 эВСД на несколько строк приходного документа. Или несколько эВСД на 1 строку приходного документа. При указании 1эВСД на несколько строк — эта ситуация с юридической точки зрения является не корректной, но допустимой. Пользователь в праве отказаться от эВСД, который оформлен на несколько строк ТТН или принять его, при этом программа разобьёт эВСД на несколько партий. Такая ситуация также не регламентирована ВетИС, но на момент написания документации не запрещена.
  Позиции приходной накладной с товаром, не требующим ветеринарного сертификата в документ «Оформление входящих партий» не попадают и по таким позициям выводятся предупреждающие сообщения. Например. «Для номенклатуры «…» не установлена связь с продукцией ВетИС!»;
• если система не смогла автоматически подобрать для какой-то позиции эВСД, это следует сделать вручную. При этом может потребоваться запустить регламентное задание вручную, либо попросить поставщика выслать нужный ВСД через систему «Меркурий»;
• после проведения документа «Оформление входящих партий» в использованных ВСД ставится отметка «Погашен» и они, через регламентное задание, отсылаются в систему «Меркурий»;
• если реальное количество товара не совпало с объемом, указанным в эВСД, то при гашении эВСД, по которому была зафиксирована недостача, в систему «Меркурий» будет отправлен возвратный сертификат на объём недопоставленной продукции. Данный сертификат будет отражен в списке «Входящие» у поставщика данной продукции;
• после получения системой «Меркурий» погашенного эВСД, указанный в эВСД объем продукции списывается с остатков поставщика и записывается в остатки получателя товара, за исключением объемов продукции, оформленных возвратным сертификатом;
• в случае выявления излишков товара по акту расхождения, «Меркурий» списывает с остатков поставщика только указанное в эВСД количество. На выявленный излишек поставщик должен оформить через «Меркурий» новый эВСД.

Фиксация в системе «Меркурий» перемещения продукции, требующей электронной сертификации, между торговыми объектами или складами ХС осуществляется по аналогичной схеме. Фиксация перемещения требуется в том случае, если меняется площадка, где находится продукция и/или собственник продукции. Перемещение внутри одной площадки, без передачи прав собственности на продукцию не требует фиксации в ВетИС.